Eliseu Paglioli nasceu em Caxias do Sul (RS) no dia 28 de dezembro de 1898, filho de Francisco Paglioli e de Jacomina d’Ambroz Paglioli.

Médico formado pela Faculdade de Medicina de Porto Alegre, foi prefeito de Porto Alegre de janeiro a novembro de 1951. No decorrer da década de 1950, foi diretor do Instituto de Neurocirurgia, professor catedrático da Faculdade de Medicina de Porto Alegre e reitor da Universidade do Rio Grande do Sul.

Nomeado, em setembro de 1962, ministro da Saúde do governo parlamentarista de João Goulart durante a gestão de Hermes Lima como primeiro-ministro, exerceu essa função até janeiro do ano seguinte. Posteriormente, retornou à reitoria da universidade, à frente da qual permaneceu até abril de 1964, quando se demitiu por considerar-se identificado com o regime deposto pelo golpe militar de 31 de março desse ano.

Faleceu em Porto Alegre no dia 22 de dezembro de 1985.

Foi casado com Ada Beck Paglioli, com quem teve quatro filhos.