Anísio Botelho nasceu no dia 31 de dezembro de 1908, em Cuiabá, filho de Ancieto Pinto Botelho e de Leodomila Lima de Almeida Botelho.

Aluno da Escola Militar do Realengo, no Rio de Janeiro, entre 1926 e 1930, integrou a quarta turma de cadetes da arma de aviação. Com a criação do Ministério da Aeronáutica em janeiro de 1941, passou a integrar a Força Aérea Brasileira. Primeiro comandante da Escola de Especialistas de Guaratinguetá (SP), foi chefe de gabinete do ministro da Aeronáutica, major-brigadeiro Vasco Alves Seco, de 1955 a 1956.

Comandante do Comando de Transporte Aéreo de 1957 a 1961, em 1963 assumiu o comando da IV Zona Aérea, com sede em São Paulo, pela qual respondeu até junho do mesmo ano. Nessa ocasião, foi nomeado ministro da Aeronáutica pelo presidente João Goulart (1961-1964). Botelho teve problemas na organização do gabinete diante da situação de confronto existente na Força Aérea. Em setembro, desencadeou-se, em Brasília, a Revolta dos Sargentos, com participação de elementos da Marinha e da Aeronáutica, logo dominada.

No dia 31 de março de 1964, um golpe militar afastou Goulart do poder, mas Anísio Botelho permaneceu à frente do Ministério da Aeronáutica até o dia 4 de abril. No dia 13 do mesmo mês passou para a reserva e, no dia seguinte, teve seus direitos políticos suspensos pelo prazo de dez anos, com base no Ato Institucional nº 1 (AI-1), primeiro elemento formalizador das transformações políticas introduzidas pelo novo regime, que incluía punições extralegais dos partidários do presidente deposto.

Faleceu no dia 7 de março de 1986, no Rio de Janeiro.

Foi casado com Sotair Fernandes Botelho, com quem teve dois filhos.